Początki Zakładu sięgają roku 2006, kiedy to zarządzeniem Rektora ówczesnej Śląskiej Akademii Medycznej w ramach Katedry Analizy Instrumentalnej Wydziału Farmaceutycznego z Oddziałem Medycyny Laboratotyjnej powołano Zakład Statystyki. Kierownikiem utworzonej jednostki została dr n. med. Katatrzyna Klimek, która funkcję tę pełniła do roku 2013.
W latach 2013 - 2020 kierowikiem Zakładu był prof. dr hab. n. med i n. o zdrowiu inż. Aleksander Owczarek, a od roku 2020 do chwili obecnej funkcję kierownika pełni dr hab. n. farm. Elżbieta Chełmecka.
W następstwie zmian organizacyjnych w obrębie Wydziału Nauk Farmaceutycznych, Rektor Śląskiego Uniwersytetu Medycznego z dniem 1 paździenika 2023 roku przekształcił Zakład Statystyki Katedry Analizy Instrumentalnej w samodzielny Zakład Statystyki Medycznej.